骨关节炎患者滑膜组织miRNA-mRNA相互调控网络及分子作用机制的研究

作者:徐扬; 吴驷东; 钱臣; 朱斌杰
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目的通过生物信息学分析,探讨骨关节炎患者滑膜中miRNA mRNA的表达及其分子机制。方法 miRNA和mRNA数据来自基因表达综合(GEO)。利用 R 4.0.3筛选出差异表达的miRNA和mRNA,通过go富集分析鉴定差异基因的主要富集细胞成分、生物学过程和分子功能,通过KEGG富集途径分析鉴定差异基因的主要富集信号途径。通过funrich 3.1。3 ,对差异表达miRNAs的靶基因进行预测,并对预测的靶基因和差异表达mRNA进行Venn制备,以获得共同的差异基因。基于MiRNA和共同差异基因构建MiRNA mRNA。结果GSE55457 采用alpine技术检测健康患者和骨关节炎患者滑膜的基因表达,GSE126677 采用RNA测序技术检测健康患者和骨关节炎患者滑膜的miRNA表达。最后,通过数据分析,共有 113 显著下调差异表达mRNA,Yale显著上调差异表达mRNA,9 显著上调差异表达miRNA,本田显著下调差异表达miRNA。功能富集分析表明,差异表达的mRNA涉及细胞成分、生物学过程和分子功能。巴黎银行KEGG富集途径分析表明,差异表达的mRNA主要参与整合素、细胞生长因子等信号通路的调节。通过funrich 3.1获得差异表达miRNA的预测靶基因。3 。与本研究中差异表达的mRNA相交后,共获得 9 的差异表达miRNA和 19 的相应mRNA。基于miRNA与mRNA之间的相互调节关系,成功构建了miRNA-RNA调控网络。结论通过构建骨关节炎患者滑膜组织中miRNA mRNA的相互表达,初步阐明了骨关节炎患者滑膜组织病理改变的具体分子机制,为后续骨关节炎的诊断和治疗提供了潜在的分子基础