玉米mi R395基因家族生物信息学分析及靶基因预测
作者:王丽; 路运才
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MicroRNA(miRNA)具有调节基因表达的功能。为了揭示玉米miR395基因家族的进化规律、表达模式和功能,进行了基因定位、多序列比对、顺式作用元件分析、二级结构分析、靶基因预测和表达模式分析。结果共鉴定出16个成员,均集中在2号和10号染色体上。19个碱基完全相同,表明它们在进化过程中高度保守。共有18个ABRE类顺式作用元件,推测它们通过参与调节ABA的信号转导来提高玉米的抗逆性。大多数靶向基因参与硫酸盐同化,转录组分析表明,zmamiR395基因家族的一些成员表达下调。该结果为后续玉米相关基因的功能分析奠定了基础。