[目的]研究添加生物炭对芒果园杧果根层土壤养分含量、根系生长和土壤微生物群落结构的影响，为芒果园科学应用生物炭提供理论参考。[方法]以杧果台农一号为研究对象，设置常规施肥（CK）、常规施肥与3%生物炭（BC）和水肥一体化与3%生物炭（FBC）三个处理，分析土壤养分和根系形态的变化，并利用Illumina高通量测序技术比较了土壤细菌和高通量测序真菌群落的差异。[结果]与CK相比，BC和FBC处理的土壤中pH和有机质含量增加，BC处理的果实期土壤中碱解氮和速效磷含量显著增加，BC和FBC处理的开花期土壤中速效钾含量显著增加。根质量密度和根长密度在果实期显著增加，根平均直径差异不显著，根盒维数为BC>FBC>CK。BC处理增加了土壤细菌种类的数量、丰度和多样性，降低了土壤真菌多样性。BC处理降低了细菌的丰度和多样性。BC和FBC治疗增加了变形菌门（Proteobacteria）、厚壁菌门（Firmicutes）、芽单胞菌门（Gemma、timonadetes）和担子菌门（Basidiomycota）的微生物群落丰度，绿弯菌门（Chloroflexi）和子囊菌门（Ascomycota）的微生物群落丰度下降。用BC处理的胞菌属（Gemma、timonas）、鞘脂单胞菌属（Sphingomonas）和水恒杆菌属（Mizugakiibacter）的含苞单体显著富集，而用FBC处理的芽孢杆菌属（Bacillus）、Acidibacter、链格孢属（Alternaria）和青霉属（Penicillium）的含苞单体显著富集。冗余分析结果表明，有机质、钾和速效磷含量是土壤细菌和真菌群落结构变化的驱动因子，pH是真菌群落结构变化的驱动因子，根系生长发育受土壤环境因子的调控。[结论]添加生物炭有利于提高芒果园土壤养分有效性，改善土壤微生物环境，促进根系生长。