以2011-2020年中国30个省、市、自治区规模以上工业企业面板数据为例，从投入产出的角度，按照创新价值链理论，将企业的技术创新活动分为两个阶段：技术成果研发和技术成果转化。构建两阶段StoNED模型来计算和研究创新资源配置效率，并利用Tobit模型对两阶段效率值的影响因素进行回归分析。结果表明，我国规模以上工业企业两个阶段的创新资源配置效率呈现出倒U型的趋势。各地区之间的效率差异明显，从高到低排列为“东－中－西”。区域经济发展水平和科研实力正向影响技术成果研发阶段的效率，而企业的资产规模和关注度正向影响技术成果转化阶段的效率，政府支持对这两个阶段的效率没有明显影响。研究结论为区域以上工业企业制定和实施创新驱动发展战略等政策提供了新的依据。