目的从学生主动学习行为的角度评价独立实验设计的教学效果，为进一步推进医学机能学教学改革和教学质量提供依据。方法2019年6月，选择186名湘雅医学院五年制和八年制学生作为研究对象。对独立实验设计教学中学生的主动学习行为进行了抽样调查。Logistic回归采用Spearman等级相关分析法对数据进行分析。SPSS23.0软件用于调查数据的描述性分析。在实验设计中，72.6%（186.8%）的学生能够积极参与实验设计/科学防御，186.8%（186.8%）的学生能够积极参与实验设计/科学防御。主动性学习行为“尝试提出新的科学问题”与提高科研思维能力教学效果的相关系数达到0.81。只有42.5%（79/186）的学生同意学生在报告后参与总结。结论医学功能独立实验设计教学受到学生的广泛欢迎和认可，有效地培养了学生的科研能力和创新精神。在教学过程中能否充分调动学生积极的学习行为与教学效果密切相关。在自主实验设计教学中，需要加强学生领导力和领导力意识的培养。